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作为一所接受大量美国国防部资助的高校，安全问题对佐治亚理工学院来说更为敏感。加州大学伯克利分校和佐治亚理工学院都对报告提出了异议，伯克利校方还在声明中表示，原则上伯克利开展的研究是向全世界开放的，该校未发现清华-伯克利深圳学院的伯方教职员工有从事其他目的的研究。